Рассмотрев вопрос, мы пришли к следующему выводу:
Медицинское учреждение обязано заполнять наименование организации в листках нетрудоспособности.

Обоснование вывода:
Согласно ст. 183 ТК РФ при наступлении временной нетрудоспособности работодатель выплачивает работнику соответствующее пособие.

В соответствии с ч. 5 ст. 13 ЗаконаN 255-ФЗ для назначения и выплаты пособий по временной нетрудоспособности застрахованное лицо обязано представить листок нетрудоспособности, выданный медицинской организацией по форме и в порядке, которые установлены федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим функции по выработке государственной политики и нормативно-правовому регулированию в сфере обязательного социального страхования.

Форма бланка листка нетрудоспособности утверждена приказом Минздравсоцразвития России от 26.04.2011 N 347н «Об утверждении формы бланка листка нетрудоспособности». Заполнение бланка листка нетрудоспособности производится в соответствии с главой IX «Заполнение листка нетрудоспособности» Порядка выдачи листков нетрудоспособности, утвержденного приказом Министерства здравоохранения и социального развития РФ от 29.06.2011 N 624н (далее — Порядок).

На сегодняшний день изменения, касающиеся правил заполнения листка нетрудоспособности сотрудником медицинской организации, ни в Порядок, ни в саму форму листка не внесены.

С учетом положений п. 58 Порядка заполнение в листке нетрудоспособности строки «место работы — наименование организации» в разделе «Заполняется врачом медицинской организации» является не правом, а обязанностью сотрудника медицинского учреждения. При этом, как установлено в п. 58 Порядка, информация о месте работы — наименовании организации указывается сотрудником медицинского учреждения со слов гражданина.

Незаполнение строки «место работы — наименование организации» в разделе «Заполняется врачом медицинской организации» можно квалифицировать как нарушение медицинским учреждением порядка заполнения листка нетрудоспособности, установленного главой IX Порядка. Это подтверждается и судебной практикой: смотрите, например, решение Серпуховского городского суда Московской области от 13.02.2012 по делу N 2-385/2012, решение Зеленоградского районного суда города Москвы от 30.09.2011.

Поэтому в случае представления работником листка нетрудоспособности с незаполненной строкой «место работы — наименование организации» в разделе «Заполняется врачом медицинской организации» следует рекомендовать работнику обратиться с данным листком нетрудоспособности к сотруднику медицинского учреждения, производившему его заполнение, для устранения нарушения порядка заполнения листка нетрудоспособности, установленного главой IX Порядка N 624н.*(1)

К сведению:
Работодатель не обязан принимать к оплате листки нетрудоспособности, оформленные с нарушениями законодательства, поскольку при неправильном оформлении листка нетрудоспособности расходы, произведенные работодателем на выплату работнику пособия, могут быть признаны нецелевым расходованием средств обязательного социального страхования, а потому не подлежащими зачету. Право ФСС России не принимать к зачету расходы на обязательное социальное страхование, произведенные с нарушением законодательства, закреплено в пп. 3 п. 1 ст. 11 Федерального закона от 16.07.1999 N 165-ФЗ «Об основах обязательного социального страхования».

Согласно письму ФСС России от 30.09.2011 N 14-03-11/15-11575 в случае возникновения у страхователя сомнений в правильности оформления листка нетрудоспособности страхователю необходимо обращаться в региональные отделения ФСС России; принятие по данному вопросу самостоятельных решений страхователем недопустимо.